رصدت غرفة عمليات المجلس القومى لحقوق الإنسان الأحد 437 شكوى كانت قد تلقتها غرفة العمليات إلى اللجنة العليا، المشرفة على الاستفتاء تضمنت انتهاكات ومخالفات عدة خلال عملية الاستفتاء. وكانت أبرز الانتهاكات التي تم رصدها من قبل مراقبي المجلس طوال فترة التصويت في تلك المرحلة تأخر فتح بعض مقار اللجان الانتخابية وممارسة الدعاية التوجيهية أمام مقار بعض اللجان، وتوجيه إرادة لبعض الناخبين داخل بعض اللجان وخارجها. كما رصدت منع بعض المراقبين من ممارسة مهامهم وعدم اعتراف بعض رؤساء اللجان وقوات تأمين اللجان بتصاريح المراقبة التي يحملونها وجود تصويت جماعي، ببعض اللجان وتوزيع رشاوى انتخابية أمام بعض اللجان الانتخابية، وتسويد بطاقات من قبل رؤساء بعض اللجان الانتخابية. وتم منع بعض الناخبين من دخول بعض اللجان الانتخابية وارتباك إداري وسوء تنظيم خلال جولة التصويت في بعض اللجان وعدم وجود كشوف الناخبين ببعض اللجان، وتكرار الأخطاء بها. وغلق بعض اللجان قبل الموعد المحدد لانتهاء التصويت رغم قرار اللجنة بتمديد مدة التصويت