أكد خبراء الصحة أن زهرة البابونج يفيد في تخفيف آلام الدورة الشهرية، وشفاء قروح المعدة بسرعة، ويستنشق المغلي لإزالة التهاب تجاويف الفم، وتغسل به العيون المتعبة. وفي الطب الحديث يوصف زهر البابونج شرابا، فيغلى 2 جرام من الزهر في مائة جرام من الماء لتنشيط الهضم وجلب النوم.

وبنسبة أربعة جرامات في مائة جرام من الماء لعلاج التشنج وحفظ الحرارة، ومغص المعدة والامعاء والمرارة وعوارض الهستيريا وإسهال الأطفال والتهاب المجارى البولية، والصداع ويستعمل البابونج لتسكين التهابات الجلد، وذالك بوضعه في ماء الحمام، كما توضع كمادات منه على أماكن آلام الروماتيزم والنقرس، وأيضا يتم غليه للغرغرة للتخلص من التهابات الحلق، وغسل الرأس به يمنع سقوط الشعر، ويصبغه بلون أشقر.

وتستخدم رؤوس أزهار البابونج كمادات لعلاج تقيحات الأسنان، ومنشطات طاردة للريح، ومقوية للأعصاب ومساعدة للهضم.